Groupe de recherche sur les moteurs biologiques

Bienvenu sur la page du groupe de recherche en biophotonique du professeur Simon Rainville.
Nous faisons parti du département de physique de génie physique et d'optique de l'Université Laval et du Centre d'optique, photonique et laser (COPL).

Professeur Simon Rainville
Simon.Rainville@phy.ulaval.ca
Téléphone: 418 656-2131 poste 12511
Télécopieur: 418 656-2623
Pavillon d'optique-photonique, local 2139
Dép. de physique, de génie physique et d'optique
Université Laval
Québec, Canada
G1K 7P4

Étudiants
Guillaume Paradis (PhD)
Ismael Duchesne (MSc)
Stéphanie Jolicoeur (MSc)

Alumni
Anne-Marie Roy (stage)
Mathieu Gauthier (PhD)
Alexandre Bastien (MSc)
Simon Duval (stage)
Hugo Bergeron (stage)

Le moteur flagellaire bactérien est une machine assez complexe, nécessitant 40-50 gènes pour son expression, l'assemblage et le contrôle. En outre, il est incorporé dans les multiples couches de la membrane bactérienne. Cela explique pourquoi, contrairement à beaucoup d'autres moteurs moléculaires, il n'a pas encore été étudiés in vitro. Comme les études spectaculaire de moteurs linéaires (comme la kinésine, myosine et la dynéine) ont clairement démontré, un système in vitro permet le contrôle essentiel des paramètres expérimentaux pour réaliser l'étude précise des caractéristiques physiques et chimiques du moteur. Ainsi, l'objectif de notre laboratoire au cours des cinq dernières années a été l'élaboration d'un système in vitro unique pour étudier quantitativement le moteur flagellaire bactérien.

Notre système se compose d'une bactérie filamenteuse Escherichia coli partie introduit à l'intérieur d'une micropipette. Des impulsions laser femtosecondes (60 fs et ~ 15 nJ / impulsion) sont alors étroitement axées sur la partie de la bactérie qui se trouve au coeur de la micropipette. Ces impulsions percent un trou de taille inférieur au micromètre dans la paroi de la bactérie, ce qui nous donne accès à l'intérieur de la cellule ainsi que le contrôle de la force proto-motrice qui alimente le moteur. Grâce à un amplificateur patch-clamp, nous appliquons une tension externe entre l'intérieur et l'extérieur de la micropipette. En variant la tension appliquée, nous observons les variations de la vitesse de rotation du moteur. La vitesse de rotation est obtenue en utilisant la microscopie vidéo de filaments fluorescents.

Nous sommes toujours à la recherche d'étudiants motivés et passionnés par le travail expérimental. N'hésitez pas à contacter Simon Rainville pour discuter des possibilités de stage/projet, maîtrise, doctorat ou stage postdoctoral en biophotonique.

Si vous êtes admissible, il est particulièrement recommandé d'appliquer pour une bourse (particulièrement du CRSNG et du FQRNT). Consultez cette page du site du Bureau des bourses et de l'aide financière pour plus de détails. Notez qu'il est recommandé de commencer vos démarches de demande de bourses l’année précédant votre admission à la maîtrise ou au doctorat (les dates limites sont généralement le 1 octobre). Cela vous assurera, si vous êtes boursier, de profiter de ce financement pour la totalité de votre programme d'études.

Notre groupe est associé au département de physique et au programmes d'études graduées en biophotonique.

Voici une affiche présentée par notre groupe à la conférence BLAST XI tenue à New Orleans (USA) en janvier 2011.

• Mathieu Gauthier, Dany Truchon, et Simon Rainville, “Taking control of the flagellar motor,” dans Photonics North 2008, vol. 7099

• S Rainville et al., “Taking Control of the Bacterial Flagellar Motor,” Physics in Canada 64, n°. 3 (2008).

• Memoire Alexandre Bastien (2010)

• Zone privée pour les membres du laboratoire
• Groupe de Howard C. Berg (Harvard)
  
• Groupe de Richard Berry (Oxford)
  
• Quantitative biology in Canada
  

Simon Rainville s'intéresse également à la recherche sur l'enseignement de la physique. Voir cette page.